ระบบจัดการงานเอกสารที่มีความยืดหยุ่นสูง คือ ระบบที่สามารถปรับเปลี่ยนการทำงานและโครงสร้างได้ตามความต้องการของแต่ละแผนก โดยไม่จำเป็นต้องสร้างระบบใหม่ทั้งหมด ช่วยให้แต่ละฝ่ายสามารถใช้งานได้อย่างสะดวกและเหมาะสมที่สุด 

     ตัวอย่างเช่น ฝ่ายการเงินอาจต้องการระบบที่รองรับการอนุมัติเอกสารแบบเร็วและปลอดภัย ส่วนฝ่ายบุคคลอาจต้องการระบบค้นหาและเก็บรักษาข้อมูลพนักงานอย่างง่ายดาย ระบบยืดหยุ่นสามารถปรับแต่งความสามารถในแต่ละด้านให้เหมาะสมกับแต่ละแผนกได้